Una muestra de hisopado bucal es colectada mediante la inserción de la punta de un hisopo bucal en el interior de la mejilla, se realiza un frotis de las células del epitelio bucal (superficie) deslizando la torunda de arriba hacia abajo y viceversa. Esta técnica transferirá el ADN que contienen las células a la punta de la torunda. Una vez en el laboratorio, el ADN se extrae de la punta de la torunda a través de una serie de lavados y luego es amplificada por un proceso llamado PCR (reacción en cadena de polimerasa). La PCR creará muchas copias de la secuencia de ADN con el fin de maximizar la visibilidad en un analizador genético.
Un analizador genético es una máquina que detecta y lee los alelos, o formas de los genes y produce perfiles de ADN del producto de PCR. El analizador creará un gráfico-como la interpretación del perfil de ADN, que un analista utilizará para interpretar y hacer su informe. Cuando un estudio de comparación se realiza, como en una prueba de paternidad, por ejemplo, el analista comparará los perfiles de ADN obtenidos a partir de la prueba de las partes, es decir, el supuesto padre y el niño, para determinar el número de alelos comunes compartidos y calcular una probabilidad de relación, es decir, la paternidad.

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